Футбольный клуб «Чиатура» из грузинского города Чиатура был основан в 1956 году. Команда выступала в первенстве Грузинской ССР, а в 1990 году стала одним из основателей чемпионата Грузии. В сезоне 1991/92 «Чиатура» заняла второе место в чемпионате страны, а в следующем сезоне стала бронзовым призёром. В 1995 году команда впервые выиграла Кубок Грузии.

В сезонах 1996/97 и 1997/98 «Чиатура» дважды становилась чемпионом Грузии. В эти же годы команда дебютировала в еврокубках, приняв участие в Кубке обладателей кубков и Кубке УЕФА. В сезоне 2000/01 «Чиатура» стала обладателем Кубка Грузии во второй раз.

В последующие годы команда выступала нестабильно, занимая места в середине турнирной таблицы чемпионата Грузии. В 2010 году «Чиатура» заняла последнее место в чемпионате и вылетела в первую лигу. В 2012 году команда вернулась в высший дивизион, однако в следующем сезоне вновь вылетела в первую лигу.

В сезоне 2015/16 «Чиатура» заняла первое место в первой лиге и вернулась в высший дивизион. В сезоне 2017 года команда заняла 10-е место в чемпионате Грузии и осталась в высшем дивизионе.

В настоящее время «Чиатура» выступает в Лиге 3 Грузии, третьем по значимости дивизионе страны.