Футбольная команда "Компраг Авсюнино" была основана в деревне Авсюнино, в Выборгском районе Ленинградской области в 2012 году. Изначально команда была создана для участия в местных соревнованиях, но вскоре начала выступать на более высоких уровнях.

В 2015 году "Компраг Авсюнино" выиграла чемпионат Ленинградской области и получила право выступать в первенстве России по футболу среди команд второго дивизиона (зона "Запад").

В дебютном сезоне в ПФЛ "Компраг Авсюнино" занял 10-е место в своей группе. В сезоне 2016/17 команда улучшила свои результаты и заняла 6-е место.

В сезоне 2017/18 "Компраг Авсюнино" впервые в своей истории вышла в финальный этап Кубка России, где уступила в четвертьфинале московскому "Спартаку" со счетом 0:3.

В сезоне 2018/19 "Компраг Авсюнино" занял 4-е место в своей группе в ПФЛ и вышел в стыковые матчи за выход в Футбольную национальную лигу (ФНЛ). Однако в стыковых матчах команда уступила "Томи" из Томска и осталась в ПФЛ.

В сезоне 2019/20 "Компраг Авсюнино" занял 11-е место в своей группе в ПФЛ. В сезоне 2020/21 команда заняла 7-е место.

Принципиальным соперником клуба является «Новгород».